181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3337 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  89.51 
 
 		 162 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  67.07 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  66.86 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  66.27 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  66.47 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  65.87 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  64.67 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  63.1 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  61.96 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  61.31 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  59.64 
 
 		 173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  60.24 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  56.55 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  54.55 
 
 		 373 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  51.76 
 
 		 181 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.8 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2797  gluconate kinase  51.08 
 
 		 209 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.654483  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.53 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.55 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  49.34 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.95 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  52.38 
 
 		 195 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.81 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  51.81 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  51.27 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  44.65 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0046  carbohydrate kinase  50.61 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.324095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  44.51 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  43.04 
 
 		 174 aa  148  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  48.19 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  47.83 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0327  carbohydrate kinase  49.39 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  49.68 
 
 		 429 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  48.19 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  48.19 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  47.44 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.44 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.15 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.63 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0956  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  48.78 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  48.39 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  45.86 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  44.44 
 
 		 779 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  50.66 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  46.41 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.79 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  44.6 
 
 		 172 aa  134  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.94 
 
 		 759 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.4 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.33 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  40.74 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  41.88 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  41.77 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  41.77 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  41.77 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  42.24 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.45 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.62 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  44.08 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9123  gluconokinase  48.34 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.51 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  47.37 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  47.37 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  47.37 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  44.44 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  44.44 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  45.22 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  46.79 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  46.15 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.21 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  41.14 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.75 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  43.75 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  40.37 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  46.67 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  40.37 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  45.81 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  40.37 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  40.37 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  40.37 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.83 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  40.13 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  40.13 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  40.13 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  40.13 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  38.86 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  39.49 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  39.49 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.49 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  39.75 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  39.49 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  40.13 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  39.49 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  44.81 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.89 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.56 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  39.51 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  45.39 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  39.75 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>