187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1469 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  96.63 
 
 
178 aa  356  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  96.63 
 
 
178 aa  356  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  68.07 
 
 
170 aa  243  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  64.67 
 
 
167 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  64.67 
 
 
167 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  67.47 
 
 
175 aa  238  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  64.67 
 
 
167 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  65.66 
 
 
172 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.58 
 
 
178 aa  230  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  63.25 
 
 
175 aa  230  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  58.43 
 
 
172 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  60.84 
 
 
174 aa  218  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  59.04 
 
 
187 aa  215  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  59.04 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.04 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  59.04 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  57.49 
 
 
174 aa  214  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  58.43 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  59.88 
 
 
173 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  59.17 
 
 
171 aa  210  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  57.83 
 
 
176 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  57.83 
 
 
176 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  57.83 
 
 
176 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  57.83 
 
 
176 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  57.83 
 
 
176 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  56.89 
 
 
174 aa  204  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  55.09 
 
 
191 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  55.09 
 
 
191 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.49 
 
 
186 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  54.49 
 
 
191 aa  197  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  49.38 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  48.77 
 
 
175 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  48.77 
 
 
175 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  48.77 
 
 
175 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  48.77 
 
 
175 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  48.77 
 
 
175 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  48.77 
 
 
182 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  49.38 
 
 
164 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  49.38 
 
 
164 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  49.38 
 
 
164 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.38 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  49.38 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  48.15 
 
 
182 aa  177  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  48.15 
 
 
175 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  51.18 
 
 
179 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  50.61 
 
 
175 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  48.12 
 
 
164 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  52.12 
 
 
181 aa  167  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  47.06 
 
 
202 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.19 
 
 
178 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.24 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.9 
 
 
208 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.56 
 
 
179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.31 
 
 
178 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.15 
 
 
182 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.8 
 
 
167 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  49.38 
 
 
170 aa  147  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  46.34 
 
 
178 aa  147  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  44.71 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  47.27 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  48.19 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.4 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  47.17 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.81 
 
 
176 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  48.75 
 
 
169 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 
161 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 
161 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.37 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  46.71 
 
 
429 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  45.03 
 
 
179 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.54 
 
 
179 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.65 
 
 
180 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  46.54 
 
 
179 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.12 
 
 
174 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.72 
 
 
167 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  46.84 
 
 
171 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  46.84 
 
 
171 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  42.24 
 
 
166 aa  141  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  46.84 
 
 
171 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  45.81 
 
 
166 aa  141  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  46.45 
 
 
179 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  43.95 
 
 
170 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  44.17 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  44.65 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  51.82 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  43.71 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  40.61 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  43.68 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.44 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  47.24 
 
 
162 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  46.72 
 
 
174 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  42.14 
 
 
164 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  40.61 
 
 
172 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  40.85 
 
 
171 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  43.48 
 
 
167 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  40.61 
 
 
172 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  40.61 
 
 
172 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  43.64 
 
 
373 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>