189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0666 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  75.15 
 
 		 174 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  72.46 
 
 		 171 aa  264  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  72.05 
 
 		 173 aa  256  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  62.65 
 
 		 167 aa  227  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  62.65 
 
 		 167 aa  227  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  62.05 
 
 		 167 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  58.58 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.45 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  57.49 
 
 		 178 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56 
 
 		 175 aa  214  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.3 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  57.49 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  57.49 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.36 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.23 
 
 		 170 aa  207  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  54.12 
 
 		 174 aa  197  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  52 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  52 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  52 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  52 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  52 
 
 		 176 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  54.66 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.66 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  52.8 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  54.66 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  54.66 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  54.55 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  54.55 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  54.55 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  53.5 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  52.87 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  54.66 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  53.5 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  53.5 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  53.5 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  53.5 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  53.5 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.94 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  53.46 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  53.46 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  53.46 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  53.5 
 
 		 182 aa  187  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.19 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  54.19 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  52.83 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  48.8 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  48.41 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  45.96 
 
 		 175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.1 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.24 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.88 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  47.85 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.17 
 
 		 208 aa  157  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.06 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.99 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  47.56 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  50 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.06 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.26 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.15 
 
 		 169 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  46.5 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  45.81 
 
 		 429 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.34 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  47.4 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  47.4 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  47.4 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.33 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  44.72 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 424 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.04 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  43.37 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.01 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  40.24 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.37 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.14 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  40.85 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  41.94 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  39.24 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.41 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.65 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  42.24 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  40.24 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  41.77 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.83 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  44.3 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  41.98 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  41.61 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  40.99 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  40.99 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  41.29 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  40.99 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  40.99 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  40.99 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  40.99 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  40.99 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  41.25 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>