188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001959 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  86.39 
 
 		 173 aa  305  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  84.81 
 
 		 171 aa  287  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  75.15 
 
 		 174 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  61.45 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  61.45 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  60.84 
 
 		 178 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  60.84 
 
 		 167 aa  217  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  60.24 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  60.24 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  60 
 
 		 175 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  60.24 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.64 
 
 		 172 aa  210  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.58 
 
 		 178 aa  208  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.83 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  58.43 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  57.65 
 
 		 174 aa  197  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  58.49 
 
 		 191 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  58.49 
 
 		 191 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  58.49 
 
 		 191 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.86 
 
 		 186 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  57.76 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.76 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  57.76 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  57.76 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  57.76 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  55.28 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  52.47 
 
 		 175 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  55.28 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  52.56 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  55.28 
 
 		 176 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  55.28 
 
 		 176 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  55.28 
 
 		 176 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  52.47 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  52.47 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  52.47 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  52.47 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  52.47 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.12 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  51.85 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  53.12 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  49.39 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  52.6 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  52.6 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  52.6 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  51.3 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  48.8 
 
 		 181 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.78 
 
 		 178 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.45 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.2 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  46.06 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  46.58 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.4 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.4 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.65 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  47.1 
 
 		 429 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.1 
 
 		 208 aa  151  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.23 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.51 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.12 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.83 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.51 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.51 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  41.32 
 
 		 180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.01 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  44.16 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.25 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  43.87 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  46.1 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.29 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  45.22 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  45.22 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  45.22 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  41.21 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.75 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  44.87 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  47.76 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  41.18 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  42.42 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  47.26 
 
 		 424 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.24 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.48 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  41.46 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  44.44 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  41.77 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  47.01 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.21 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  42.77 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  42.86 
 
 		 237 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  41.36 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  41.83 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  38.32 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  36.88 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  41.03 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  45.52 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.79 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.48 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  39.49 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  40 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.39 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>