More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1272 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 424 aa  832    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 228 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 220 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 220 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  44.04 
 
 		 220 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.58 
 
 		 220 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 221 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  51.61 
 
 		 234 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  46.12 
 
 		 260 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  45.12 
 
 		 229 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  50.68 
 
 		 233 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.12 
 
 		 220 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  46.9 
 
 		 231 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  49.32 
 
 		 230 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 228 aa  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 234 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.16 
 
 		 163 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  43.52 
 
 		 226 aa  150  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  46.58 
 
 		 171 aa  150  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  43.53 
 
 		 262 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  48.77 
 
 		 162 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  47.4 
 
 		 174 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  48.85 
 
 		 241 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 232 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  42.31 
 
 		 224 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  49.38 
 
 		 169 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.3 
 
 		 178 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  47.14 
 
 		 236 aa  147  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  53.54 
 
 		 237 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  45.88 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.59 
 
 		 190 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.27 
 
 		 175 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  40.55 
 
 		 230 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.19 
 
 		 178 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 		 169 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  46.49 
 
 		 232 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 241 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  44.2 
 
 		 232 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  46.41 
 
 		 173 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  44.54 
 
 		 232 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 		 231 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.79 
 
 		 759 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 262 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  46.3 
 
 		 171 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  46.67 
 
 		 180 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  46.3 
 
 		 171 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 		 185 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  40.85 
 
 		 232 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  46.3 
 
 		 171 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  46.91 
 
 		 170 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 262 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  46.98 
 
 		 232 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  47.16 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 		 169 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  49.76 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 236 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  45.69 
 
 		 232 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.24 
 
 		 185 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  52.41 
 
 		 167 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  54.48 
 
 		 779 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.11 
 
 		 180 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  47.24 
 
 		 165 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.96 
 
 		 167 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  47.81 
 
 		 226 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  45.33 
 
 		 230 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 223 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  46.45 
 
 		 170 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  47.26 
 
 		 174 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  46.99 
 
 		 175 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  42.22 
 
 		 239 aa  138  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  45.7 
 
 		 232 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.91 
 
 		 186 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.62 
 
 		 180 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  43.91 
 
 		 232 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  47.47 
 
 		 184 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  44.64 
 
 		 235 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  47.8 
 
 		 237 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  38.91 
 
 		 233 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 236 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.24 
 
 		 179 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  46.58 
 
 		 167 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 		 175 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.99 
 
 		 208 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  46.58 
 
 		 167 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  38.05 
 
 		 230 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  37.07 
 
 		 228 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 250 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  37.07 
 
 		 228 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  45.25 
 
 		 232 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.79 
 
 		 165 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 229 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  43.35 
 
 		 222 aa  137  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  47.17 
 
 		 181 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>