259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0485 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.98 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.52 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  42.79 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.14 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  43.72 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.26 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  41.55 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  40.98 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  39.56 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  39.46 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  41.86 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  42.31 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  42.27 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  40.19 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  36.68 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  38.94 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  39.46 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  40.48 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  40.36 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  40.26 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  40.72 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  38.68 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  37.04 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  41.62 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  42.22 
 
 		 424 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  42.53 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  39.29 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  39.29 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  43.89 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  44.13 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  42.16 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  40.53 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  44.57 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  42.01 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  39.46 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  39.17 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  41.38 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  42.57 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  42.57 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  36.16 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  36.84 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  37.95 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  40.8 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  34.22 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  34.22 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  37.78 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  36.84 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  38.25 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  37.1 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  38.03 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.14 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  36.57 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  41.35 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  40.44 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  42.23 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  40.37 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  40.45 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  40.1 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  36.82 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  37.21 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  41.01 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>