260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1750 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  87.07 
 
 		 232 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  64.07 
 
 		 233 aa  301  4.0000000000000003e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  65.09 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  61.43 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  54.3 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  55.86 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  54.75 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  52.47 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  48 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  50.45 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  52.36 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  48.66 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  48.21 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  46.98 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  46.88 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  47.16 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.89 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  46.76 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  46.76 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  47.16 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  43.51 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  42.17 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  43.22 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  43.22 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  45 
 
 		 231 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.88 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  42.08 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  43.67 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  41.43 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  43.22 
 
 		 287 aa  168  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  42.36 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  44.39 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  44.26 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  48.33 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  43.26 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  47.85 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  42.04 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  43.24 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  42.99 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  40.74 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  42.6 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  43.33 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  41.86 
 
 		 236 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  40.74 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  42.59 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  42.22 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  42.31 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  41.77 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  40.44 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  46.04 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  42.41 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  41.33 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  41.51 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  43.12 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  43.3 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  41.52 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  40.54 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>