259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4885 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 237 aa  466  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  72.46 
 
 		 236 aa  347  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  70.04 
 
 		 237 aa  345  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  72.88 
 
 		 236 aa  344  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  70.46 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  68.35 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  68.35 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  68.4 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  58.59 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  59.03 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  57.71 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  55.86 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  54.35 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  57.46 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  54.02 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  53.91 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  56.64 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  53.57 
 
 		 231 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  52.7 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  51.69 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  53.42 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  50.7 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  52.51 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  53.88 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  53.21 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  50 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  51.83 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  50.7 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  50.68 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  52.23 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  51.66 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  44.25 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  54.21 
 
 		 206 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  45.85 
 
 		 287 aa  188  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  45.58 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  44.16 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  43.62 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  43.03 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  44.05 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  54.93 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  42.44 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  43.83 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  44.65 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  46.54 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.26 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  45.07 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  44.24 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.81 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  46.92 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  46.3 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  44.24 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  42.58 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  46.95 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  43.69 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4847  ribose-5-phosphate isomerase A  45.67 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2538  ribose-5-phosphate isomerase A  43.12 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  0.356045 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  46.15 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  45.37 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  43.52 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  41.78 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  41.78 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1709  ribose-5-phosphate isomerase A  45.19 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03207  ribose-5-phosphate isomerase A  48.7 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.335569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  46.76 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  45.83 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>