260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2632 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 240 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  68.35 
 
 		 235 aa  294  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  65.82 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  62.61 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  68.35 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  54.22 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  52.34 
 
 		 206 aa  197  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  52.23 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  47.44 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  49.14 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 236 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  50.43 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  46.88 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  48.66 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  49.37 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  49.33 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  49.59 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  49.14 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  46.67 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  49.56 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  45.11 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  44.83 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  44.4 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  46.22 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  46.88 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  46.88 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  45.09 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  43.39 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  43.88 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  39.06 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  46.69 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  43.93 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  40.17 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  45.76 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  37.28 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  44.25 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  45.61 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  38.16 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  42.26 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  38.16 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  42.62 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  38.16 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  46.38 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  46.15 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  45.54 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  40.42 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  41.77 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  41.49 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  43.53 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  40.25 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  36.94 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  43.64 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  42.15 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  41 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  43.46 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  40.57 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  40.57 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  39.06 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2542  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  37.34 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  39.84 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  47.12 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  40.51 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  42.25 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  41.22 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  39.66 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>