259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0401 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  97.49 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  95.82 
 
 		 239 aa  463  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  82.43 
 
 		 239 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  66.53 
 
 		 234 aa  319  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  53.67 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  53.49 
 
 		 236 aa  204  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  51.83 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  53.02 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  50.7 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  48.84 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  48.61 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  44 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  48.15 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  45.62 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  46.08 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  43.18 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  43.18 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  46.08 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  44.64 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  46.08 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  44.64 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  47.06 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.54 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  43.05 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  41.48 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  42.03 
 
 		 206 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  40.87 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  43.6 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 262 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  41.07 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  42.22 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  43.32 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  43.27 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  43.96 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  40.71 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0629  ribose 5-phosphate isomerase A  39.29 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0779  ribose 5-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  41.7 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  41.59 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  41.38 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  39.56 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.66 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  41.97 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  39.38 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1176  ribose-5-phosphate isomerase A  40.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  36.84 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  41.85 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0093  ribose-5-phosphate isomerase A  43.66 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  41.31 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0422  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  37.99 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0315  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04310  ribose-5-phosphate isomerase A  40.42 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000120698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5150  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5203  ribose-5-phosphate isomerase A  40.59 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0108  ribose-5-phosphate isomerase A  42.72 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  42.52 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5057  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  37.75 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  39.57 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  38.73 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  43.06 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4136  ribose 5-phosphate isomerase  40.95 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00349227  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  38.36 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  40.65 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  39.01 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  37.56 
 
 		 287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>