260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0832 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  62.61 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  57.64 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  64.47 
 
 		 226 aa  238  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  56.22 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  52.56 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  48.4 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 236 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  48.67 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  46.29 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  49.53 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  49.53 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  47.09 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  45.16 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  47.66 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  50 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  52.72 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  46.52 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  47.16 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  48.03 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  47.96 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  49.1 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  45.09 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  44.64 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  45.33 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  48.03 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  45.09 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  49.48 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  44.54 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 232 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  44.2 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  41.15 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  41.99 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  41.45 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  41.45 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  41.86 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  43.41 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  42.61 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  40.77 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  41.15 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  38.36 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  43.44 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05060  ribose-5-phosphate isomerase, putative  41.59 
 
 		 302 aa  138  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  43.48 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  42.16 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 262 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  39.17 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.01 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  43.64 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  40 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  39.17 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  37.79 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  38.25 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  38.71 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  39.64 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2542  ribose-5-phosphate isomerase A  39.65 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  36.73 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  40.36 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>