259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0584 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  70.31 
 
 		 237 aa  335  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  70.13 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  70.13 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  68.83 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  68.4 
 
 		 236 aa  320  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  68.4 
 
 		 237 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  66.52 
 
 		 236 aa  305  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  65.52 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  62.66 
 
 		 236 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  64.66 
 
 		 239 aa  281  9e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  61.8 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  60.62 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  63.06 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  62.27 
 
 		 231 aa  264  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  61.82 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  61.36 
 
 		 231 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  62.07 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  49.78 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  50.95 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  51.08 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  51.52 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  51.39 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  49.78 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  53.02 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  53.74 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  52.09 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 231 aa  195  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  52.78 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  50.9 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  51.5 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  50.43 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  48.67 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  44.13 
 
 		 239 aa  183  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  45.58 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  51.55 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  45.16 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  46.54 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  42.61 
 
 		 287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  44.58 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  43.33 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  43.46 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.38 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.47 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  47.51 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  45.41 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  42.27 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  42.26 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  42.26 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  40.17 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  50.22 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  44.95 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  41.56 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  42.98 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  41.41 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  45.09 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 220 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  41.92 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  40.61 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  41.33 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  40.89 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  45 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  41.3 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  41.3 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  40.47 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  42.73 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  39.56 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>