260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1386 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  63.85 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  61.09 
 
 		 237 aa  270  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  63.13 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  51.8 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  51.82 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  50.25 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  48.61 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  54.37 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  55.26 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  51.15 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  50.9 
 
 		 241 aa  194  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  47.71 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  49.77 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  48.15 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  48.77 
 
 		 236 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  47.79 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  44.14 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  49.05 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  49.14 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  49.03 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  46.01 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  49.52 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  45.5 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  45.07 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.27 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  54.11 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  46.6 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  45.16 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  48.36 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  42.34 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  49.1 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.12 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.2 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  46.6 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  42.73 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  47.64 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  45.63 
 
 		 231 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  46.04 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  52.63 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  44.33 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  42.54 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  44.66 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  47.09 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  47.44 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  50.74 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  38.74 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  44.55 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  40.17 
 
 		 287 aa  158  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  41.83 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  41.12 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  47.12 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  42.34 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  47.09 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  41.96 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  37.26 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  37.26 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  41.89 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  46.46 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  39.21 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  45.63 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  42.6 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  41.56 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  45.63 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  40.76 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  42.41 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  40.62 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  43.75 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  38.5 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  42.41 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  38.94 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  46.7 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  43.9 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  40.54 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  44 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  44.71 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  48.72 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>