259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0159 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  65.8 
 
 		 232 aa  311  6.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  66.67 
 
 		 232 aa  291  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  64.07 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  57.4 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  54.98 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  57.6 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  53.46 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  44.84 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  49.56 
 
 		 262 aa  201  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  48.18 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  48.68 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  48.68 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  45.58 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  48.64 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  49.31 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  46.15 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  47.17 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  46.23 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  43.84 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.75 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  45.02 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.87 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  42.11 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  40.99 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  44.33 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  40.54 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.28 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  41.1 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  41.7 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  42.15 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  42.15 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  40.79 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  39.65 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  44.5 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  42.52 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  37.55 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  44.02 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  40.38 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  39.04 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  41.31 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0129  ribose-5-phosphate isomerase A  38.97 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  40.95 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  39.48 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  40.28 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2088  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  40.47 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  38.99 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  38.91 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  42.6 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  40.18 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2156  ribose-5-phosphate isomerase A  38.32 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  38.91 
 
 		 236 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  38.81 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1526  ribose-5-phosphate isomerase A  42.16 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>