259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18901 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  98.73 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  73.08 
 
 		 239 aa  351  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  74.04 
 
 		 237 aa  351  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  73.08 
 
 		 239 aa  341  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  70.94 
 
 		 238 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  65.64 
 
 		 237 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  68.78 
 
 		 231 aa  301  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  65.93 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  63.91 
 
 		 231 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  62.66 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  59.45 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  59.45 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  54.91 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  55.76 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  54.35 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  55.96 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  57.14 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  46.82 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  46.36 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  47.85 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  47.2 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  46.01 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  45.37 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  44.21 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  45.5 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  44.83 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  49.25 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  45.49 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  44.64 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  45.09 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.86 
 
 		 220 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  41.67 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  43.24 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  39.47 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.12 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.31 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  41.99 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  46.15 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  44.25 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  44.25 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  39.65 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  42.41 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 218 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  45 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  39.21 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  43.38 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  40.64 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5150  ribose-5-phosphate isomerase A  43.85 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5057  ribose-5-phosphate isomerase A  43.85 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0315  ribose-5-phosphate isomerase A  43.85 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  40.87 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  43.84 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  43.44 
 
 		 230 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  41.55 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4223  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  41.95 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  39.65 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5203  ribose-5-phosphate isomerase A  43.85 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  40.1 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  43.61 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  38.29 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  42.49 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04310  ribose-5-phosphate isomerase A  42.45 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000120698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0422  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  40.74 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  40.45 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  40.45 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  44.2 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  41.12 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  42.22 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  42.49 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  40.18 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  42.47 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  41.36 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  40.87 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>