259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0742 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  48.9 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  49.56 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  48.2 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  44.92 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  45.29 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  45.63 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  45.15 
 
 		 236 aa  168  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  45.25 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  41.52 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  41.1 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  40.64 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.01 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  41.52 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  41.7 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  43 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  40.64 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  40.37 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  43.12 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  43.58 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0677  ribose 5-phosphate isomerase A  38.26 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  37.99 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  41.74 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  38.91 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  37.55 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  37.55 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  37.55 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  37.12 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  37.12 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  36.68 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.73 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  40.26 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  38.33 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  38.74 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  38.74 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  37.1 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  36.24 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  37.1 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  36.28 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  37.07 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  41.13 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  39.65 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  36.68 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  39.01 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  40.62 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  36.94 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  37.95 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  37.91 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  37.91 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  36.68 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  39.04 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  38.26 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  40.58 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  39.63 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  39.73 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  37.84 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  40.54 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  36.94 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  38.25 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>