260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0677 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0677  ribose 5-phosphate isomerase A  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 
237 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  38.14 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  38.14 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  39.42 
 
 
231 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  38.71 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  39.42 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 
234 aa  138  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  38.7 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  37 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  36.56 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  36.53 
 
 
239 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  36.41 
 
 
236 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  33.8 
 
 
236 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  37.98 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  37.56 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  36.76 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  38.5 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  36.65 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  34.93 
 
 
238 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  35.29 
 
 
241 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  37.56 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  38.03 
 
 
236 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  38.03 
 
 
236 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  36.96 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  36.96 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  37.39 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  36.92 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  36.23 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  38.68 
 
 
224 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  36.4 
 
 
220 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  36.4 
 
 
220 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  36.4 
 
 
220 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  34.15 
 
 
234 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  36.4 
 
 
220 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  36.4 
 
 
220 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  38.58 
 
 
228 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  36.36 
 
 
221 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  36.52 
 
 
220 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  33.99 
 
 
222 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  38.28 
 
 
228 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  34.91 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  35.85 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  33.33 
 
 
232 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  36.89 
 
 
223 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  29.87 
 
 
424 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  32.37 
 
 
233 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  31.53 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  32.31 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  35.47 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  32.33 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  33.49 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  33.95 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  30.5 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  34.12 
 
 
232 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  32.43 
 
 
287 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  34.12 
 
 
232 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  33.8 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  31.22 
 
 
237 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  35.75 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  33.94 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  32.2 
 
 
250 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  35.21 
 
 
232 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  35.81 
 
 
231 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  30.25 
 
 
250 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  37.24 
 
 
224 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  30.2 
 
 
229 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  34.29 
 
 
228 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  30.96 
 
 
240 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2287  ribose-5-phosphate isomerase  34.13 
 
 
227 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.562329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  34.56 
 
 
232 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  35.15 
 
 
236 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  33.62 
 
 
236 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  30 
 
 
235 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  31.75 
 
 
228 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  34.65 
 
 
232 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  31.91 
 
 
262 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  33.62 
 
 
236 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  31.07 
 
 
237 aa  101  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  31.8 
 
 
230 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  36.62 
 
 
230 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  33.91 
 
 
233 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  32.72 
 
 
235 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  29.91 
 
 
255 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  31.11 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  34.83 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  31.91 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  32.14 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1958  ribose 5-phosphate isomerase  36.67 
 
 
227 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  31.91 
 
 
262 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  32.17 
 
 
236 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  31.19 
 
 
260 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  31.05 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  31.73 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  32.29 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  32.41 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2516  ribose-5-phosphate isomerase A  31.9 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  33.48 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  31.25 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>