260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1200 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  74.44 
 
 
223 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  66.67 
 
 
222 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  67.26 
 
 
223 aa  304  7e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 
229 aa  205  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 
237 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 
223 aa  149  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  40.79 
 
 
231 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 
234 aa  145  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  41.94 
 
 
236 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  41.01 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  40.55 
 
 
236 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  39.56 
 
 
239 aa  141  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  41.12 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  41.12 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  38.67 
 
 
239 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  39.63 
 
 
239 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  39.63 
 
 
236 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  37.99 
 
 
231 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 
237 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 
237 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  36.68 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  39.63 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  40.1 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  39.63 
 
 
237 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  39.73 
 
 
241 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  36.92 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  37.16 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  37.16 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  38.79 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 
239 aa  128  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.06 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  36.53 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  38.14 
 
 
215 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  34.82 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  37.95 
 
 
218 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 
232 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  35.27 
 
 
230 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  43.33 
 
 
228 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  40.27 
 
 
228 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  33.79 
 
 
220 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  45.18 
 
 
236 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1056  ribose-5-phosphate isomerase A  38.79 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  35.81 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  35 
 
 
287 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  33.79 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  32.72 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  33.79 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  35.21 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  41.55 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  34.84 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  35.21 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  37.79 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 
233 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  32.89 
 
 
236 aa  118  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2616  ribose-5-phosphate isomerase A  33.33 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  36.87 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  41.87 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  36.87 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  38.76 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  33.33 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  33.95 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  35.93 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 
232 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  37.67 
 
 
235 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 
235 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  37.09 
 
 
219 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  38.12 
 
 
232 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3508  ribose-5-phosphate isomerase A  36.11 
 
 
218 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846939  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  36.61 
 
 
227 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  35.94 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 
232 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0108  ribose-5-phosphate isomerase A  40.39 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  40.67 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  38.6 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  36.62 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  36.06 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  38.91 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  36.62 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  35.65 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  39.51 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0629  ribose 5-phosphate isomerase A  37.38 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0093  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0779  ribose 5-phosphate isomerase  37.38 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  36.28 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2134  ribose-5-phosphate isomerase A  34.74 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213318  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  37.73 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  37.85 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  39.13 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  39.3 
 
 
231 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>