259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0218 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  41.38 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  40.67 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  39.51 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  37.33 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.7 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  38.92 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  36.71 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  37.09 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  35.55 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  38.78 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.57 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  39.49 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  39.49 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  39.2 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  38.05 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  39.49 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  39.49 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  39.49 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  38.5 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  37.95 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  36.94 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  38.65 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  40.51 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  39.44 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  39.44 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  36.67 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  39.13 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  39.02 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  39.61 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  38.94 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  41.45 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  36.79 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  35.82 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  35.82 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  37.2 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  35.61 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  35.61 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  36.59 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  38.07 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  33.64 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  37.21 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  36.45 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  37.76 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  37.93 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  39.8 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  36.41 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  35 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  35.29 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  34.72 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  39.18 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  34.98 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  35.12 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  37.2 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  34.98 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  35.78 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  38.81 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  37.9 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  36 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  33.85 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  34.74 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  34.48 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  34.45 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  36.15 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  34.15 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  35.71 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  35.12 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  36.99 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  36.99 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  32.72 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  34.15 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  33.66 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  36.79 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  36.84 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  36.6 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  37.62 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2088  ribose-5-phosphate isomerase A  35.78 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  35.5 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  38.27 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  34.33 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  36.89 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  34.74 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  33.5 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  37.31 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2206  ribose-5-phosphate isomerase A  34.78 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  34.01 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  35.71 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>