259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1611 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  66.67 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  62.5 
 
 		 232 aa  297  7e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  65.09 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  55.71 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  54.02 
 
 		 227 aa  244  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  54.22 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  55.41 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  51.38 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  48.67 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  52.97 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  51.6 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  49.11 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 262 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  49.31 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  48.6 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  47.73 
 
 		 262 aa  185  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  48.13 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  46.7 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  48.13 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  47.51 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  46.05 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  47.03 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  46.73 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  48.17 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.04 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  43.86 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  43.11 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  49.24 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  43.4 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  46.38 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  44.86 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  44.29 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  42.15 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.76 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  45.71 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  42.79 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  39.29 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  42.15 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  42.98 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  43.84 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  42.2 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  42.2 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  42.4 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  44.14 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  41.59 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  41.41 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  45.23 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  42.5 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  43.3 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  42.41 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  39.56 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  43.69 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.2 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  41.74 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  44.39 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  41.46 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  41.33 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  45.07 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  41.46 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  44.61 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  41.46 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  41.46 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  38.7 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  41.55 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  39.9 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  40.47 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  42.54 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5203  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  37.83 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>