260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0089 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  51.75 
 
 		 250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  49.25 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  48.76 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  48.76 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  48.76 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  48.76 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  47.39 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  48.26 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  50.23 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  45.93 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  47.5 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  46.77 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  46.77 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  47.68 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  48.67 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  47.56 
 
 		 262 aa  191  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  45.66 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  46.67 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  43.72 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  47.91 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  48.58 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  45.62 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  43.44 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  48.06 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  48.53 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  43.3 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  43.32 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  48.22 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  50.49 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  51.28 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  44.65 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  45.71 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  47.14 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  45.12 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  49.52 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  46.26 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  41.51 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  50.49 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  48.02 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  42.61 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  46.23 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  42.65 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  43.96 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  45.36 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  41.94 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  41.47 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  41.47 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  45.18 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  42.08 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  40.55 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  46.79 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  40.64 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  40.64 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  48.4 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  41.43 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  42.58 
 
 		 236 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  48.56 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  40.99 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  40.49 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  45.71 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  42.47 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  42.47 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  37.72 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  42.58 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  42.58 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  45.07 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>