260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2538 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 224 aa  450  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  63.84 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  63.06 
 
 		 226 aa  300  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  54.3 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  54.98 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  57.21 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  53.18 
 
 		 227 aa  234  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  52.25 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  50.22 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  54.3 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 231 aa  224  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  49.32 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  46.72 
 
 		 232 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  46.29 
 
 		 232 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  45.85 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  46.29 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  48.6 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  44.78 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  48.37 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  45.37 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  47.03 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  43.42 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  47.06 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  47.03 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  44.26 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  46.12 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  46.05 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  45.58 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  40.97 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  46.58 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  44.5 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  46.54 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  40.79 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  40.79 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  45.13 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  42.33 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  45.59 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  42.13 
 
 		 250 aa  167  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  41.36 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  43.52 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  44.12 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  39.17 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  43.91 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  47.03 
 
 		 235 aa  161  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  45.05 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  43.4 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  42.59 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  43.91 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  44.8 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  43.48 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  44.5 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.83 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  41.31 
 
 		 236 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  42.72 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  43.64 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  43.87 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  43.75 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  40.09 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  41.86 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  41.94 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  43.75 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  39.21 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  38.74 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  38.7 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  43.87 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  39.46 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  39.64 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  39.46 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 239 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  39.19 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  39.64 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  39.64 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>