261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0773 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 231 aa  460  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  63.64 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  55.39 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  50.24 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  54.59 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  48.11 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  50.25 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  50.68 
 
 		 237 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  47.16 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  49.3 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  49.3 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  47.14 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  49.76 
 
 		 236 aa  192  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  47.44 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  48.08 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  46.73 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  52.27 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  45.13 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  47.2 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  43.42 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  46.29 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  46.73 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  44.69 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  48.83 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  42.6 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  46.76 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  43.81 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  43.98 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  45 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.52 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  38.84 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.52 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  46.77 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  39.04 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  40.65 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  44.02 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.79 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  41.36 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  44.8 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  42.34 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  42.18 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  43.24 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  42.47 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  42.13 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  40.97 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  41.05 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  41.05 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  41.23 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  39.38 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  44.61 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  45.1 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  35.55 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  38.22 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  38.67 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  37.75 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  37.75 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  43.27 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  39.13 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  36.56 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  40.65 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  38.76 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  38.96 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  41.1 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  37.91 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  41.31 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  41.62 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  39.21 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  42.31 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  40.61 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>