259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76151 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05060  ribose-5-phosphate isomerase, putative  51 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148727  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02440  ribose 5-phosphate isomerase A (AFU_orthologue; AFUA_6G10610)  43.23 
 
 		 273 aa  174  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  42.52 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  38.3 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  38.82 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  42.52 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  40.62 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  38.2 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  41.15 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  37.13 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  38.29 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  40.74 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  40.6 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  38.65 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  38.5 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  37.87 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  39.75 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  42.38 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  39.04 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  38.6 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  38.6 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  37.02 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  36.73 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  37.97 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  37.89 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  37.91 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  36.79 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  36.27 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  35.85 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  36.92 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  37.12 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  36.73 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  40.21 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  34.85 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  38.58 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  38.31 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  36.28 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  39.21 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  35.61 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  33.62 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  36.08 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  36.36 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  35.29 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  34.8 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  34.8 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  34.8 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  34.8 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  34.8 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  36.19 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  37.95 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  33.19 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  38.43 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  36.44 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  34.76 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  36.97 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  38.36 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  34.76 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  37.56 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  38.43 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  38.03 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  38.03 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  33.47 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  34.2 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  35.86 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  35.38 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  36.23 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  36.23 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  32.64 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  36.55 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  37.89 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  35.35 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  34.96 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  31.4 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  36.6 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  33.49 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  35.24 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  33.62 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  33.19 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  31.4 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  35.27 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  35.19 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  35.71 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  33.19 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  32.24 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  33.05 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  36.57 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  33.33 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  30.17 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>