259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2404 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  75.88 
 
 		 230 aa  356  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  41.46 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.93 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.93 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.93 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.93 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  42.93 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.44 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.06 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.87 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.61 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  36.48 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  39.39 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  41.21 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  36.05 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  36.05 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  41.6 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  43.69 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  39.22 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  41.75 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  36.96 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  41.23 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  39.83 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  39.32 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  39.92 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  41.95 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  39.05 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  38.79 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  35.78 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  40.2 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  36.8 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  36.09 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  39.32 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  38.86 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  36.6 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  43.2 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  37.66 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  38.07 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  38.1 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  36.09 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  39.32 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  35.53 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  41.35 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  40.1 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  40 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  40.76 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  37.73 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  37.38 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  35.19 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  36.62 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  37.28 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  31.9 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  35.37 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.12 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  39.8 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  34.89 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  35.81 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  38.05 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  37.07 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  35.59 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  35.82 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  36.44 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  35.85 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  38.27 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  37.68 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  35.38 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  32.23 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  36.49 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  35.55 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  36.65 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  34.22 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  32.89 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  36.36 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  36.79 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  36.07 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1709  ribose-5-phosphate isomerase A  36.1 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>