259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0662 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  71.56 
 
 		 223 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  66.67 
 
 		 223 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  67.42 
 
 		 223 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  43.6 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  39.35 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  42.4 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  42.47 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  41.23 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  43.06 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  40.55 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  39.73 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  43.38 
 
 		 238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  40.55 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 236 aa  144  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.24 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  42.4 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  43.32 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  41.47 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  39.3 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  39.3 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  40.55 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  40.43 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  40.43 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  42.51 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  38.81 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  39.46 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1958  ribose 5-phosphate isomerase  33.63 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  36.74 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  39.15 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  40 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0629  ribose 5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0779  ribose 5-phosphate isomerase  40.09 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  39.27 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  38.01 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  39.82 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3508  ribose-5-phosphate isomerase A  39.55 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846939  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  40.45 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  36.07 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  36.07 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2616  ribose-5-phosphate isomerase A  36 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  38.32 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  37.99 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0093  ribose-5-phosphate isomerase A  42.08 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  37.73 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0108  ribose-5-phosphate isomerase A  42.57 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  37.62 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1056  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  36.36 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  37.62 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  37.16 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  35.24 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  37.16 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  33.64 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  35.27 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  36.36 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  35.09 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  34.02 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  37.16 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  43.88 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  36.99 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  34.76 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2134  ribose-5-phosphate isomerase A  36.82 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  37.14 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0816  ribose-5-phosphate isomerase A  35.78 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2542  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  38.57 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  36.97 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  35.44 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  38.1 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03207  ribose-5-phosphate isomerase A  38.76 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.335569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>