260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_50995 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  72.5 
 
 		 250 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 228 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  48.1 
 
 		 223 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  46.19 
 
 		 230 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  43.75 
 
 		 232 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  45.85 
 
 		 237 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 236 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  46.67 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  46.67 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.33 
 
 		 232 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  44.17 
 
 		 232 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  42.98 
 
 		 227 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 		 220 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  46.44 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 220 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 220 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 220 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.17 
 
 		 220 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 237 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 220 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  43.53 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.04 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  42.61 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  45.15 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  44.26 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  43.59 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  44.68 
 
 		 230 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 229 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  43.35 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  42.32 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  44.8 
 
 		 232 aa  172  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  45.19 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  43.15 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  43.03 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  42.04 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  45.45 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  38.11 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  39.04 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  41.1 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  38.56 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 224 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  38.12 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  46.12 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.57 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  46.12 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  43.44 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  42.68 
 
 		 231 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  36.84 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  39.44 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  40.17 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  39.58 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  44.8 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  40.35 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  43.22 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  41.1 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  41.96 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  41.74 
 
 		 237 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  41.99 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  40.42 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  37.13 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  38.1 
 
 		 238 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  37.28 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 232 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  41.32 
 
 		 232 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  44.88 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1568  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  41.88 
 
 		 232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  39.06 
 
 		 228 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  38 
 
 		 235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  36.84 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 231 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  38.17 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  38.14 
 
 		 231 aa  143  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  36.92 
 
 		 238 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  37.86 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  38.4 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  40.51 
 
 		 235 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>