259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0364 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  62.93 
 
 		 232 aa  259  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  55.39 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  54.21 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  53.14 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  55.26 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  52.34 
 
 		 240 aa  197  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  55.08 
 
 		 237 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  56.08 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  54.55 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  54.21 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  49.76 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  42.51 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  51.55 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  51.87 
 
 		 236 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  48.94 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  56.25 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  50.8 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  52.72 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  46.86 
 
 		 239 aa  176  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  48.7 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  48.7 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  47.15 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  48.94 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  47 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  46.6 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  46.81 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  43.96 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 236 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  47.5 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  43 
 
 		 239 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  43 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  47 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  44.74 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  45.63 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  42.03 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  43.4 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  45.5 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  44.27 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.09 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.85 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  44.98 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  43.22 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  47.89 
 
 		 235 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 220 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  42.71 
 
 		 231 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.38 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.71 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  44.62 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  44.04 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  43.68 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.01 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  41.71 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  43.98 
 
 		 232 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  45.26 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  43.98 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  41.71 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  43.5 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  44.17 
 
 		 231 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  41.04 
 
 		 250 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  41.15 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  38.07 
 
 		 232 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  46.74 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  45.7 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  44.27 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  40.96 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.68 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  45.64 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  41.2 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40.65 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  45.03 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  45.08 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  44.62 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 262 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  45.7 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 262 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  45.08 
 
 		 236 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  43.62 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  43.62 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  43.62 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  40.72 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03207  ribose-5-phosphate isomerase A  46.77 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.335569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>