260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1135 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 226 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  68.35 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  67.24 
 
 		 250 aa  271  8.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  64.47 
 
 		 228 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  64.07 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  57.48 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  52.75 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  54.93 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  51.15 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  56.25 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 236 aa  201  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  53.85 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  54.15 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  52.25 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  52.73 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  50.48 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  50 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  49.76 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  51.36 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  52.11 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  52.4 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  52.4 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  46.15 
 
 		 236 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  50.22 
 
 		 241 aa  187  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  46.15 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  54.36 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  45.87 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  45 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  45 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  43.58 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  45.18 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  43.24 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  46.67 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  45.61 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  42.41 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  40.37 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.99 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  40.37 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  38.99 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  42.38 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  49.55 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  44.64 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  45.26 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  45.93 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  43.3 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 		 239 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  41.1 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  47.06 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  44.74 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  48.11 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  44.3 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  42.98 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  50.48 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  47.12 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  46.27 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  43.75 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  44.86 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  38.39 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  49.52 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  49.52 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  44.55 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  40.34 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  42.99 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  43.14 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  40.36 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  44.67 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0816  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  43.33 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  45.59 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  42.36 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  44.13 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  44.7 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2542  ribose-5-phosphate isomerase A  42.08 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  42.52 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  42.52 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>