260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1945 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  75.74 
 
 
235 aa  348  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  65.82 
 
 
240 aa  288  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  67.24 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  56.22 
 
 
228 aa  236  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  55.45 
 
 
232 aa  222  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
236 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  53.42 
 
 
237 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 
237 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  51.08 
 
 
241 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  51.79 
 
 
237 aa  201  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  50.68 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  54.37 
 
 
227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  47.22 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  47.16 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  56.08 
 
 
206 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  49.32 
 
 
237 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  49.32 
 
 
237 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  50.23 
 
 
237 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  50.43 
 
 
236 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  50.95 
 
 
237 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  49.55 
 
 
234 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  49.12 
 
 
239 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  48.03 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  46.36 
 
 
237 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 
231 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 
236 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  44.49 
 
 
236 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  45.09 
 
 
237 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  45.09 
 
 
231 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  44.39 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  47.32 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.44 
 
 
221 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  45.09 
 
 
231 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  47.35 
 
 
238 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  39.46 
 
 
234 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 
239 aa  170  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 
220 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 
220 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  40.36 
 
 
220 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 
235 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 
220 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 
220 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 
220 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 
220 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 
220 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  40.81 
 
 
220 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  45.98 
 
 
224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 
239 aa  164  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  41.92 
 
 
239 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  46.49 
 
 
230 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  40.87 
 
 
230 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 
239 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 
228 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  40.34 
 
 
231 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  44.09 
 
 
236 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  42.98 
 
 
287 aa  159  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  44.21 
 
 
250 aa  155  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 
232 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  39.82 
 
 
225 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 
232 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  43.64 
 
 
262 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  40.53 
 
 
228 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 
230 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  44.76 
 
 
232 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  42.62 
 
 
232 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  42.61 
 
 
232 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 
231 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  43.44 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 
233 aa  146  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  41.95 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  36.71 
 
 
224 aa  145  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  44.35 
 
 
226 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  40 
 
 
237 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  44.86 
 
 
237 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 
232 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  42.37 
 
 
262 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  41.28 
 
 
241 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  42.79 
 
 
253 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  42.11 
 
 
228 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 
232 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 
262 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  40.51 
 
 
260 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 
233 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  42.54 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 
235 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  40.26 
 
 
262 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 
232 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  41.23 
 
 
221 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  44.21 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  42.24 
 
 
231 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  44.87 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  41.52 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  38.77 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  41.82 
 
 
215 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  43.15 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  40.69 
 
 
241 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  43.26 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  45.37 
 
 
235 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  39.63 
 
 
230 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>