260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3221 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  58.7 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  59.13 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  61.67 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  60.35 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  62.95 
 
 		 230 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  59.74 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  58.87 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  58.87 
 
 		 232 aa  248  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  61.16 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  62.05 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  65.84 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  62.67 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  56.13 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  51.3 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  54.88 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  55.56 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  55.11 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  51.08 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  65.82 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  59.15 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  53.91 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  53.48 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  59.15 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  54.35 
 
 		 232 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  58.69 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  52.49 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  54.19 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  50.87 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  51.58 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.41 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  49.09 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.17 
 
 		 230 aa  192  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  51.13 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  50.45 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  48.18 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  52.21 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.52 
 
 		 220 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  42.99 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  42.42 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  44.3 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  43.23 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  46.85 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  40.97 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 227 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 228 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  45.98 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  48.92 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  45.26 
 
 		 228 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  43.15 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  47.84 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  49.12 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  43.06 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  40.44 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  42.61 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  43.64 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  44.35 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  39.32 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  43.27 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  40.54 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  38.89 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  45.58 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  41.84 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  39.32 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  36.75 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  39.82 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  45.41 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1568  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  44.07 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  43.68 
 
 		 206 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  41.15 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  38.05 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  41.41 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  38.65 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  40.28 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>