260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0355 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  63.85 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  58.3 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  58.85 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  54.84 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  52.68 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  51.38 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  49.78 
 
 		 241 aa  208  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  50.24 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 236 aa  204  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  54.21 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  48.62 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  47.22 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  46.58 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  48.61 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  47.3 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  46.82 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  48.11 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  46.36 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  46.61 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  45.66 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  44.75 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  43.84 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  45.66 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  44.29 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  44.05 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  47.64 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  47.09 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  43.66 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  43.19 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.66 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  43.19 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  43.6 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  43.19 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  42.65 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  46.08 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.65 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  46.08 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.71 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  44.24 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  45.54 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  43.87 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  41.82 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  42.04 
 
 		 287 aa  165  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  42.79 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  44.95 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.07 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  43.69 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 262 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 250 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  42.08 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  43.24 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  39.61 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  40.37 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  40.45 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  43.9 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  39.82 
 
 		 250 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  43.9 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  39.82 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  43 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  43 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  42.6 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  43.9 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0842  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  38.32 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  37.84 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.24 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.38 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0960  ribose-5-phosphate isomerase A  40.55 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0969642  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  39.27 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  41.51 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  40.65 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  40.78 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  41.83 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  38.29 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  35.07 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  35.07 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>