259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1641 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  44.13 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  44.05 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  43.81 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  45.81 
 
 		 236 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  44.05 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.83 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  48.69 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  47.5 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  47.5 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  41.45 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  43.87 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  38.11 
 
 		 287 aa  164  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  40.57 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  42.59 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  46.89 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  46.89 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  46.89 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  46.89 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  46.89 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 231 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  45.93 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  44.98 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  40.61 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.98 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  42.93 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  44.13 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 220 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.51 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  44.04 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  43.58 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  43.58 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  39.38 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  43.16 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  40.34 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  37.13 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  45.77 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  40.76 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  40.47 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  42.34 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 206 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  39.75 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  39.74 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  44.09 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  40.85 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  41.59 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1568  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  41.25 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  41.89 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  40.38 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  40.38 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  40.95 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  40.64 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  37.55 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  40.54 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  38.25 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  37.91 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0677  ribose 5-phosphate isomerase A  38.7 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  40.83 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0019  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4136  ribose 5-phosphate isomerase  44.33 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00349227  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5289  ribose 5-phosphate isomerase  41.89 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  39.57 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  39.41 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  38.75 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5382  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  37.79 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0956  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4847  ribose-5-phosphate isomerase A  41.44 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  39.25 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0315  ribose-5-phosphate isomerase A  42.27 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0842  ribose-5-phosphate isomerase A  40.61 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>