259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0187 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  70.91 
 
 		 223 aa  314  7e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  71.56 
 
 		 222 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  67.26 
 
 		 223 aa  304  7e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  49.31 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  40.81 
 
 		 236 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  38.12 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  41.89 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  42.18 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  40.35 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  38.89 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  40.54 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  38.89 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  39.38 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  39.07 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  39.07 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.43 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  38.07 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  38.25 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  38.5 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  41.47 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  39.62 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  37.22 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0629  ribose 5-phosphate isomerase A  39.73 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0779  ribose 5-phosphate isomerase  39.73 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  36.07 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.04 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  38.89 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  38.38 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  37.98 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  37.88 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  37.88 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  37.88 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  39.25 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  42.54 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  42.18 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  42.18 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.67 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  34.84 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  40.61 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  38.14 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  40.44 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  36.06 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  39.51 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  40.57 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  33.48 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  36.14 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0108  ribose-5-phosphate isomerase A  40.78 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0129  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  39.35 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  35.21 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  42.38 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0093  ribose-5-phosphate isomerase A  39.81 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  37.73 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  39.15 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  39.71 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  41.06 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  40.53 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  38.36 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  38.14 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  35.65 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  35.87 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  38.64 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  42.01 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  36.79 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3508  ribose-5-phosphate isomerase A  38.25 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  35.04 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  35.02 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  38.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  37.56 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  37.61 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>