259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0327 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0327  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  43.32 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  41.23 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  40.71 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1200  ribose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  44 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  41.33 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  43.06 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  41.31 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  38.6 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  40.55 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  38.99 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  38.6 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  38.6 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  40.62 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  38.57 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  39.38 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  38.6 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  38.57 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  35.56 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  37.33 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  35.56 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  38.1 
 
 		 236 aa  128  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  37.2 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  40.49 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  36.77 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  36.97 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  39.63 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  40.36 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  35.71 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  35.27 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  36.77 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  35.87 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  36.73 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  39.74 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  37.95 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  37.12 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  37.85 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  36.2 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  35.43 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  36.07 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  34.08 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  37.44 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  35.84 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  38.94 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  38.16 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  38.28 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  35.24 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  35.24 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  36.67 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  34.7 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  35.4 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0779  ribose 5-phosphate isomerase  38.12 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0629  ribose 5-phosphate isomerase A  38.12 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  35.68 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2287  ribose-5-phosphate isomerase  38.03 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.562329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  37.75 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1056  ribose-5-phosphate isomerase A  36.44 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  35.68 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  36.89 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  35.75 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0218  ribose 5-phosphate isomerase  37.8 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  36.82 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  35.71 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  39 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  36.4 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1958  ribose 5-phosphate isomerase  35.85 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  36.65 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  37.77 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  35.53 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  36.36 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  35.4 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  34.8 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  37.56 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  37.86 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  37.98 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  35.43 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2516  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  39.71 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  33.77 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  41.84 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  35 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  37.44 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  32 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  33.33 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  37.33 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>