260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0569 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  54.84 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  51.8 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  51.77 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  47.03 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  44.25 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  46.36 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  43.36 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  45.3 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  45.91 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.08 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  43.81 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  42.79 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  41.13 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  43.39 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  41.13 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  41.04 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  42.34 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  48.94 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  40.72 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  42.72 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  40.87 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  42.45 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  42.66 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  39.06 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  39.01 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1056  ribose-5-phosphate isomerase A  40.69 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  39.09 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  41.05 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  41.13 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  37.44 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  37.44 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.58 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 239 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  41.09 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  40 
 
 		 287 aa  155  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  40.87 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  37.67 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.09 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  37.55 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  38.86 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  36.32 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  39.38 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  38.1 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  39.47 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 215 aa  148  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  41.87 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2156  ribose-5-phosphate isomerase A  38.33 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  39.56 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76151  ribose-5-phosphate ketol-isomerase  38.2 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0620962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  39.73 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  39.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  39.32 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  39.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  39.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2134  ribose-5-phosphate isomerase A  38.53 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0842  ribose-5-phosphate isomerase A  40.99 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  39.22 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  40.28 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  40.48 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0960  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0969642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  39.3 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  38.94 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  37.89 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>