259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04321 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  85.65 
 
 		 239 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  84.81 
 
 		 239 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  75.42 
 
 		 237 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  70.94 
 
 		 236 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  70.51 
 
 		 236 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  67.42 
 
 		 231 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  65.18 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  64.19 
 
 		 231 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  64.19 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  62.07 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  60.35 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  60.35 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  57.08 
 
 		 236 aa  257  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  57.08 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  55.6 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  57.71 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  56.58 
 
 		 237 aa  245  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  49.34 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  47 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  45.33 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  45.66 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  47.93 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  43.81 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  46.08 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  45.16 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  48.36 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  47.35 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 220 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  48.03 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  46.63 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  38.43 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  46.69 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  40.09 
 
 		 235 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  42.31 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  45.19 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  42.73 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  45.85 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  47 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  42.59 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  37.5 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  43.35 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  47.26 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  36.74 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  39.45 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  38.14 
 
 		 287 aa  155  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  38.66 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  42.74 
 
 		 262 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  41.35 
 
 		 262 aa  154  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  42.74 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.47 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  38.24 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  40.91 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0962  ribose 5-phosphate isomerase  39.82 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000464463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1106  ribose-5-phosphate isomerase  39.82 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  41.89 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  38.91 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0662  ribose-5-phosphate isomerase  43.38 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  39.08 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0172  ribose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  38.82 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  41.15 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  39.82 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  41.81 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  40.6 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  40.54 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  41.07 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  42.31 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  42.02 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  39.08 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  37.97 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  40.08 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  39.83 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  38.29 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  40.1 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  41.43 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  39.19 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  41.48 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  38.72 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>