259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0793 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 231 aa  476  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  54.17 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  50.92 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  50.94 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  52.61 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  48.37 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  47.73 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  47.93 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  44.69 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  52.36 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  44.78 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  43.95 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  44.16 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  44.09 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  44.05 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  41.3 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  43.64 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  43.64 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  43.06 
 
 		 253 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.23 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  43.54 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  43.54 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  40.34 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 262 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  44.6 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  44.5 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  43.26 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  40.77 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 262 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3508  ribose-5-phosphate isomerase A  43.9 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  44.78 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  39.67 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  44.95 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0816  ribose-5-phosphate isomerase A  42.93 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  42.72 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  42.72 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2156  ribose-5-phosphate isomerase A  42.42 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  42.5 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  44.39 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  39.55 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  42 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  40.79 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  41.63 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  43.84 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  39.15 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  43.3 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  39.42 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  42.71 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  37.72 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.13 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  37.66 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1176  ribose-5-phosphate isomerase A  39.62 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  39.73 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  42.86 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.65 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  41.95 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.65 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.65 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.65 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.18 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  42.42 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2616  ribose-5-phosphate isomerase A  42.71 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  39.73 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  41.71 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  42.38 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  41.5 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>