259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0557 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  49.11 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  53.77 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  50.45 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  49.32 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  50 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  48.2 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  48.18 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  44.78 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  44.09 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.44 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  41.2 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  40.91 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  41.88 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  39.48 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  43.7 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  39.57 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  41.44 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  40.26 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.19 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  39.66 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  39 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  42.11 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  40.26 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  41.33 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1076  ribose-5-phosphate isomerase A  38.16 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  40.71 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  39.32 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1232  ribose-5-phosphate isomerase A  38.16 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0408833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  39.82 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1168  ribose-5-phosphate isomerase A  37.72 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00449603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  41.12 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  39.29 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0129  ribose-5-phosphate isomerase A  38.74 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  41.1 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2088  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  38.77 
 
 		 220 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  38.46 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0816  ribose-5-phosphate isomerase A  40.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2616  ribose-5-phosphate isomerase A  38.29 
 
 		 249 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  39.37 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2068  ribose-5-phosphate isomerase A  40.19 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  38.84 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  39.25 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  38.12 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  38.91 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  41.44 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  38.01 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  40.29 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  40.29 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  38.33 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  40.28 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  38.46 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  41.82 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  38.64 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  39.01 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2156  ribose-5-phosphate isomerase A  38.5 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  37.67 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  40.49 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  38.64 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  40 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  39.51 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  40.71 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>