260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2699 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  77.12 
 
 		 236 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  76.69 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  77.12 
 
 		 236 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  66.97 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  72.69 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  68.1 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  64.57 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  65.16 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  61.09 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  63.8 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  67.12 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  63.43 
 
 		 232 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  62.96 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  58.48 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  63.43 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  62.8 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  63.32 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  60.18 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  65.75 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  64.13 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  59.28 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  52.17 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  60.78 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  62.9 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  58.26 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  58.8 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  55.31 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  58.33 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  55.41 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  53.78 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  50.22 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  53.3 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  44.93 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  44.49 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  58.74 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  51.16 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.61 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  51.32 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  49.76 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.61 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.61 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  50.43 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  52.42 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  49.76 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  48.82 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  49.28 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  55.16 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  51.9 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  46.92 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  49.28 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  51.36 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  45.78 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  48.74 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  46.76 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  43.64 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  44.21 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  43.86 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  43.23 
 
 		 287 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  48.66 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  46.85 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  49.55 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  43.05 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  42.54 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  43.38 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  42.52 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  43.44 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  47.69 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  53.67 
 
 		 424 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  40 
 
 		 236 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  39.48 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  44.98 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  46.58 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  41.59 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  43.53 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0485  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.377654  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  40.71 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  43.38 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  42.13 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  41.07 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  40.27 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2516  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>