204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3644 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.68 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.88 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.62 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  46.01 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  48.77 
 
 		 424 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  48.12 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.78 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.72 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4858  gluconate kinase  48.67 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19412  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.91 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  45 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  47.47 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  47.27 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  46.2 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  48.67 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  47.4 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  46.01 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  44.65 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  46.2 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.09 
 
 		 180 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  43.83 
 
 		 627 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  51.05 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.62 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  46.79 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  42.94 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.2 
 
 		 759 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  44.17 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  44.17 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.17 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  44.17 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  43.56 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  43.56 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  45.4 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  46.5 
 
 		 171 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  46.5 
 
 		 171 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  46.5 
 
 		 171 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  44.44 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.77 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  44.72 
 
 		 429 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  42.94 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.06 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  45 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.79 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  43.59 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  48.05 
 
 		 779 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  45.06 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  45.06 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  45.91 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  45.06 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  45.06 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  45.06 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  45.06 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  45.06 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  44.79 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  45.96 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  43.56 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.15 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.68 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  42.77 
 
 		 172 aa  130  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  43.56 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  44.79 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  43.56 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  47.06 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  44.79 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.59 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.45 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.44 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.83 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  40.99 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  43.48 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.31 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  39.75 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  40.37 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.51 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  41.14 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  41.1 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  45.34 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  44.72 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  43.37 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  42.86 
 
 		 182 aa  123  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.75 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  43.67 
 
 		 191 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  43.67 
 
 		 191 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  43.67 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  42.24 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  39.51 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.04 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  42.24 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  42.24 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.36 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  42.24 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  42.24 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.51 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  42.24 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  43.31 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  41.61 
 
 		 186 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.79 
 
 		 208 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>