195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1046 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  100 
 
 		 171 aa  353  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  85.26 
 
 		 168 aa  254  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  60.13 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  58.44 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  56.33 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  55.7 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.04 
 
 		 165 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  56.25 
 
 		 167 aa  187  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  54.66 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  54.66 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  54.66 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  54.04 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  54.04 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  54.04 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  55.06 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  53.75 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  54.43 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  53.75 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  53.75 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  53.75 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  53.75 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  53.75 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  53.75 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  50.32 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  55.97 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.4 
 
 		 180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  44.65 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.23 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.23 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4858  gluconate kinase  48.67 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19412  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  44.94 
 
 		 627 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.39 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.57 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  49.03 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.39 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.1 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  48.1 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  50.96 
 
 		 170 aa  143  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.32 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  45.62 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  45.62 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  45.62 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  45.62 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.55 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  45.62 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  45.62 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.38 
 
 		 181 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  45.62 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.1 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  45.34 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  48.1 
 
 		 429 aa  140  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  43.98 
 
 		 186 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  44.65 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  48 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  44.38 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  42.5 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.44 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.87 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  45.16 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  44.87 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  43.83 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  43.83 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  43.83 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.54 
 
 		 174 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.44 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.25 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  42.42 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.16 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  45.57 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  43.21 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  41.21 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  41.21 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  41.21 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.4 
 
 		 208 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  53.44 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1852  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.68 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  48.73 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.21 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  42.77 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.2 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  46.15 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.01 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  41.32 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  44.36 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  41.32 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  41.32 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  43.14 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  43.29 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  44.3 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  41.32 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  47.71 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  47.71 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  47.71 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  45.51 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  45.75 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  42.41 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  42.22 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.41 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>