208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2936 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  100 
 
 
177 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0695  carbohydrate kinase  53.46 
 
 
163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  47.53 
 
 
202 aa  156  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.54 
 
 
167 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.25 
 
 
173 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.87 
 
 
161 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.87 
 
 
161 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.72 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.51 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.34 
 
 
627 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.72 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  45.91 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 
169 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  45.91 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  45.91 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  45.91 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  45.91 
 
 
182 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  44.72 
 
 
184 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  45.28 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  44.38 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  44.38 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  44.38 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  44.38 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  45.91 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  43.75 
 
 
187 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.75 
 
 
187 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  43.75 
 
 
187 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.86 
 
 
162 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  45.86 
 
 
162 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  43.75 
 
 
187 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  44.38 
 
 
176 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  45.91 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  42.26 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  42.26 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  43.75 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  41.88 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  41.67 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  45.06 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  41.88 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  41.88 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  41.61 
 
 
173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  45.4 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  39.53 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  41.88 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  41.88 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  41.88 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  41.88 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  41.88 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  45.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  45.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.25 
 
 
163 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  45.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.92 
 
 
170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  45.22 
 
 
164 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.1 
 
 
176 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  40.7 
 
 
178 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.78 
 
 
200 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.83 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  41.4 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  41.25 
 
 
167 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  41.25 
 
 
167 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40 
 
 
165 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  41.25 
 
 
167 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  41.57 
 
 
178 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  45.16 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  41.25 
 
 
167 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  41.25 
 
 
167 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  41.94 
 
 
779 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  41.25 
 
 
167 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.24 
 
 
759 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  43.12 
 
 
166 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  39.13 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.59 
 
 
180 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  39.29 
 
 
171 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  43.79 
 
 
164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  38.69 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  38.69 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  41.25 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  48.92 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  43.29 
 
 
166 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  44.3 
 
 
171 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.82 
 
 
186 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.1 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  40 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.37 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  40 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  41.82 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  38.69 
 
 
169 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.86 
 
 
178 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.82 
 
 
181 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.16 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  38.1 
 
 
167 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  39.88 
 
 
167 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  40.25 
 
 
170 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.15 
 
 
178 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.59 
 
 
159 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  39.16 
 
 
170 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  41.61 
 
 
429 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.63 
 
 
208 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>