189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3640 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  100 
 
 
176 aa  357  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  64.33 
 
 
170 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.05 
 
 
176 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  54.66 
 
 
174 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.87 
 
 
759 aa  174  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  53.7 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  54.19 
 
 
779 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  54.9 
 
 
169 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  57.53 
 
 
167 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.05 
 
 
178 aa  167  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.31 
 
 
176 aa  166  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.3 
 
 
181 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  53.59 
 
 
237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  52.29 
 
 
170 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  52.26 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.48 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  52.29 
 
 
171 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  52.29 
 
 
171 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  52.29 
 
 
171 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.79 
 
 
166 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.48 
 
 
167 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.62 
 
 
181 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  48.73 
 
 
181 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  51.72 
 
 
184 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
163 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  51.92 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0597  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
170 aa  151  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.188673  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.54 
 
 
174 aa  151  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  52.9 
 
 
168 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.04 
 
 
180 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.41 
 
 
178 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.79 
 
 
167 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  44.79 
 
 
167 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  44.79 
 
 
167 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  46.01 
 
 
166 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.89 
 
 
200 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.59 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  49.39 
 
 
171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  44.16 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  48.43 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  43.56 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.79 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  43.56 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  42.94 
 
 
167 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  46.25 
 
 
165 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  44.17 
 
 
167 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  46.1 
 
 
167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  46.1 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  43.83 
 
 
164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  46.1 
 
 
167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.3 
 
 
165 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.25 
 
 
169 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.57 
 
 
182 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.05 
 
 
208 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  42.24 
 
 
176 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  42.86 
 
 
187 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 
187 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  42.68 
 
 
176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  42.68 
 
 
176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  42.86 
 
 
187 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  42.68 
 
 
176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.28 
 
 
169 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  42.68 
 
 
176 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.69 
 
 
183 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  45 
 
 
173 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  42.86 
 
 
187 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.51 
 
 
161 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.37 
 
 
185 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.51 
 
 
161 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  38.65 
 
 
174 aa  141  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.13 
 
 
182 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  41.14 
 
 
174 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  41.98 
 
 
191 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  45 
 
 
169 aa  140  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  41.98 
 
 
191 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.3 
 
 
207 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  41.98 
 
 
191 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.73 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  40.61 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.36 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.15 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.69 
 
 
175 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.07 
 
 
179 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.14 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  42.68 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  42.41 
 
 
171 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  44.3 
 
 
429 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  45.07 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  45.07 
 
 
171 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  43.4 
 
 
174 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  53.49 
 
 
156 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  45.07 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  45.07 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  45.07 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  45.07 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  45.07 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.67 
 
 
175 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  42.21 
 
 
627 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  41.88 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>