236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2408 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  100 
 
 
176 aa  357  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.15 
 
 
759 aa  197  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  60.78 
 
 
779 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  53.33 
 
 
170 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  54.43 
 
 
171 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  51.85 
 
 
167 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  54.43 
 
 
171 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  54.43 
 
 
171 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.96 
 
 
163 aa  168  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  48.24 
 
 
181 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  53.01 
 
 
237 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  53.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.31 
 
 
176 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  53.37 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  53.25 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  53.01 
 
 
178 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.38 
 
 
176 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  47.88 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  55.41 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.3 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  52.87 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.88 
 
 
181 aa  158  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  51.88 
 
 
167 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.5 
 
 
185 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.06 
 
 
185 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.76 
 
 
183 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.45 
 
 
169 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  49.13 
 
 
174 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  47.83 
 
 
169 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  43.37 
 
 
429 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.51 
 
 
175 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  46.5 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.48 
 
 
186 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.74 
 
 
200 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.18 
 
 
179 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.83 
 
 
169 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.58 
 
 
175 aa  148  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  48.41 
 
 
165 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  43.48 
 
 
191 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  43.48 
 
 
191 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  43.48 
 
 
191 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  45.86 
 
 
167 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.9 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  51.8 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.18 
 
 
178 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.06 
 
 
208 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  43.9 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.68 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  46.75 
 
 
627 aa  144  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.22 
 
 
167 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  45.22 
 
 
167 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.03 
 
 
166 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  45.12 
 
 
167 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  45.12 
 
 
167 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  45.12 
 
 
167 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.02 
 
 
165 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  43.9 
 
 
173 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  45.45 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  45.45 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  45.78 
 
 
173 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.65 
 
 
196 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  49.01 
 
 
156 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  40.12 
 
 
171 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  46.58 
 
 
166 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  43.29 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  45.91 
 
 
189 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  43.29 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  43.29 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  43.29 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  43.29 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  43.29 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.03 
 
 
172 aa  141  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.77 
 
 
167 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.22 
 
 
167 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.77 
 
 
178 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  43.95 
 
 
167 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  44.72 
 
 
166 aa  140  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.44 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  46.25 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  43.75 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.59 
 
 
178 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  42.86 
 
 
168 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.67 
 
 
180 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0597  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.54 
 
 
170 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.188673  normal  0.0425486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  41.4 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.4 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  41.4 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.21 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  44.1 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  41.4 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  43.83 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  43.83 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  41.4 
 
 
187 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.78 
 
 
181 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  44.58 
 
 
173 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  46.25 
 
 
174 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  40.37 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  43.83 
 
 
178 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  43.83 
 
 
178 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>