210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3674 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  100 
 
 		 180 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  67.46 
 
 		 182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  69.88 
 
 		 178 aa  237  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  72.78 
 
 		 167 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  67.88 
 
 		 429 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  63.75 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.6 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  58.49 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  56.9 
 
 		 188 aa  183  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.06 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  58.75 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.21 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  54.6 
 
 		 180 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.13 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  52.2 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  51.52 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  46.63 
 
 		 181 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.52 
 
 		 165 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  52.17 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  58.33 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  45.81 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  51.53 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  46.1 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  55.33 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  47.06 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  51.55 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  49.7 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  46.79 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  45.4 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  50.31 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.1 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  49.4 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.77 
 
 		 759 aa  154  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.64 
 
 		 178 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.69 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  49.69 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  49.69 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.69 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.34 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.45 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.95 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  51.92 
 
 		 779 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3878  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.31 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.689499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  48.73 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.76 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.25 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.3 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.69 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.2 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  48.48 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.04 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  49.67 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  48.73 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  45.06 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  48.78 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  48.17 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  46.06 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  50.98 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  50.98 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  50.98 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  52.83 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  50.92 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  47.77 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  48.7 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  45.91 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  45.91 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  42.31 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  42.94 
 
 		 191 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  42.94 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  42.94 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.62 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.33 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  50.94 
 
 		 160 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  44.65 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  50.6 
 
 		 237 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  43.4 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  50.31 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  54.2 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  47.59 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  44.65 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  45.45 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  43.4 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  45.45 
 
 		 167 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  45.16 
 
 		 164 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  45.45 
 
 		 167 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  45.16 
 
 		 164 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  43.4 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  43.4 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>