190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6413 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  100 
 
 
185 aa  376  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  85.41 
 
 
185 aa  322  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  63.74 
 
 
178 aa  227  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.4 
 
 
179 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  60.61 
 
 
181 aa  208  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  55.76 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  54.78 
 
 
166 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  47.5 
 
 
173 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  45.68 
 
 
171 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  53.33 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.08 
 
 
172 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  45.24 
 
 
174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.56 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  45.45 
 
 
174 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  51.3 
 
 
167 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  53.37 
 
 
202 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  52.9 
 
 
173 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.64 
 
 
175 aa  157  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  51.95 
 
 
175 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.78 
 
 
759 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  52.76 
 
 
179 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  52.15 
 
 
179 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.5 
 
 
176 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.15 
 
 
179 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  52.32 
 
 
173 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  49.68 
 
 
779 aa  154  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  46.15 
 
 
167 aa  154  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  46.15 
 
 
167 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  50.63 
 
 
175 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  51.27 
 
 
179 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  51.33 
 
 
162 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.65 
 
 
178 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.01 
 
 
170 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  50.97 
 
 
180 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  47.56 
 
 
178 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  47.56 
 
 
178 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.42 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  47.24 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  45.51 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.69 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  46.95 
 
 
177 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  48.17 
 
 
429 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  50.97 
 
 
189 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  44.87 
 
 
172 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.24 
 
 
174 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  44.31 
 
 
191 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  48.73 
 
 
174 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  44.24 
 
 
191 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.24 
 
 
186 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  44.24 
 
 
191 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9123  gluconokinase  52.17 
 
 
171 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  49.36 
 
 
164 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
190 aa  147  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.06 
 
 
181 aa  147  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  48.7 
 
 
373 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.72 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.32 
 
 
182 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.91 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.57 
 
 
182 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  44.51 
 
 
166 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  50.64 
 
 
169 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  48.08 
 
 
165 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.34 
 
 
196 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  48.17 
 
 
198 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.2 
 
 
165 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  50.3 
 
 
167 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  47.9 
 
 
175 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  51.27 
 
 
195 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.65 
 
 
178 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.3 
 
 
176 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  50.65 
 
 
171 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  50.65 
 
 
171 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  50.65 
 
 
171 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  46.99 
 
 
180 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
163 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.68 
 
 
169 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 
424 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.37 
 
 
176 aa  141  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  42.94 
 
 
170 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.39 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  41.72 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  42.95 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.95 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  42.95 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  47.1 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  47.44 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.68 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  47.44 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  42.95 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.91 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.69 
 
 
200 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  46.01 
 
 
172 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  46.01 
 
 
171 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  46.01 
 
 
172 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  46.01 
 
 
172 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  46.01 
 
 
172 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  46.01 
 
 
172 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  46.01 
 
 
172 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  47.1 
 
 
182 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>