200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4571 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  100 
 
 
163 aa  326  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  64.52 
 
 
169 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  67.52 
 
 
160 aa  204  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  64.52 
 
 
170 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  62.18 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  62.18 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  62.18 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  58.33 
 
 
759 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  59.6 
 
 
779 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  55.97 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  59.21 
 
 
237 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.96 
 
 
176 aa  168  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.96 
 
 
183 aa  165  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.99 
 
 
174 aa  164  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  55.7 
 
 
167 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  56.21 
 
 
198 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  52.5 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.65 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  50.3 
 
 
174 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.8 
 
 
176 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.57 
 
 
200 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  54.09 
 
 
167 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  50.93 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.37 
 
 
178 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
176 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  53.16 
 
 
424 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.87 
 
 
181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  46.63 
 
 
178 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  46.63 
 
 
178 aa  150  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.63 
 
 
170 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  51.59 
 
 
178 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  48.77 
 
 
167 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  48.77 
 
 
167 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  51.25 
 
 
429 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  48.77 
 
 
167 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.47 
 
 
166 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  50 
 
 
184 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.74 
 
 
178 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.05 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  50 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  45.57 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  51.25 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.83 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.68 
 
 
208 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  42.24 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.58 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  45.4 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3878  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.17 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.689499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.03 
 
 
207 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.04 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.62 
 
 
180 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  49.07 
 
 
189 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
185 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.25 
 
 
190 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.94 
 
 
167 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  47.5 
 
 
169 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  48.39 
 
 
174 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
179 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  47.1 
 
 
181 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.59 
 
 
182 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  42.41 
 
 
174 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
185 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  41.57 
 
 
173 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.41 
 
 
169 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  41.98 
 
 
187 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  41.98 
 
 
187 aa  140  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.98 
 
 
187 aa  140  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  41.98 
 
 
187 aa  140  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  50.63 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  41.98 
 
 
187 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 
167 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.1 
 
 
186 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  44.17 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  44.24 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.25 
 
 
180 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.38 
 
 
161 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  43.75 
 
 
191 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  42.86 
 
 
176 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  43.75 
 
 
191 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.38 
 
 
161 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  43.75 
 
 
191 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  41.88 
 
 
176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  42.86 
 
 
176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  42.86 
 
 
176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  49.38 
 
 
180 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  42.86 
 
 
176 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.5 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.72 
 
 
181 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  51.32 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  47.83 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  44.38 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  41.77 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  44.44 
 
 
182 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  40.25 
 
 
177 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  48.73 
 
 
175 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  44.44 
 
 
175 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.45 
 
 
175 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  43.75 
 
 
167 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  43.75 
 
 
167 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>