More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25420  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 
519 aa  1003    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.84 
 
 
490 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  43.06 
 
 
492 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.48 
 
 
503 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  43.95 
 
 
520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.02 
 
 
594 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.58 
 
 
530 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  44.62 
 
 
475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 
484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  41.57 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 
504 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  45.05 
 
 
499 aa  200  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  37.38 
 
 
498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.79 
 
 
698 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  48.08 
 
 
468 aa  196  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.53 
 
 
482 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  43.89 
 
 
483 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.5 
 
 
543 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 
365 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.73 
 
 
845 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 
365 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 
365 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 
365 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.42 
 
 
528 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.49 
 
 
511 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.72 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.88 
 
 
558 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.62 
 
 
543 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.53 
 
 
387 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.37 
 
 
427 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  30.88 
 
 
520 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  38.97 
 
 
552 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.65 
 
 
517 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.72 
 
 
478 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  34.88 
 
 
542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.68 
 
 
426 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  37.24 
 
 
966 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 
633 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.29 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 
361 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  42.15 
 
 
538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.77 
 
 
656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.14 
 
 
364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.19 
 
 
543 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  33.99 
 
 
971 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 
534 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  33.45 
 
 
992 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 
534 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  32.37 
 
 
734 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.51 
 
 
631 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.91 
 
 
420 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.57 
 
 
604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.73 
 
 
618 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  31.65 
 
 
375 aa  136  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  38.55 
 
 
1003 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.09 
 
 
598 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 
953 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  34.23 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.37 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  34.48 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  34.12 
 
 
331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  38.3 
 
 
339 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 
699 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  32.55 
 
 
1007 aa  133  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.13 
 
 
699 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  31.94 
 
 
374 aa  133  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  34.36 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  34.84 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.53 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.58 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  28.3 
 
 
541 aa  131  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.87 
 
 
688 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  35.06 
 
 
365 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.88 
 
 
596 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  31.86 
 
 
699 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  32.15 
 
 
699 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  36.15 
 
 
333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  33.08 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.16 
 
 
580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  34.57 
 
 
997 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.55 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.33 
 
 
585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.3 
 
 
395 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.74 
 
 
575 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.5 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 
637 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  34.23 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.14 
 
 
976 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  39.06 
 
 
575 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
600 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  35.06 
 
 
330 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.47 
 
 
553 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 
386 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.59 
 
 
568 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.39 
 
 
395 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.5 
 
 
990 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>