More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3517 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  100 
 
 
447 aa  919    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  53.56 
 
 
433 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  44.95 
 
 
424 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  42.89 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  41.89 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  40.78 
 
 
414 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  40.63 
 
 
406 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  39.71 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  37.68 
 
 
419 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  39.71 
 
 
405 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  39.52 
 
 
445 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  40.26 
 
 
405 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  38.14 
 
 
438 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  37.39 
 
 
440 aa  261  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  38.44 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  36.41 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  37.3 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  36.64 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  38.7 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.08 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  36.66 
 
 
454 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  38.15 
 
 
418 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  36.87 
 
 
424 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  36.6 
 
 
411 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  37.94 
 
 
424 aa  249  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  36.36 
 
 
415 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  35.87 
 
 
411 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  35.1 
 
 
453 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  38.72 
 
 
420 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  36.41 
 
 
420 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  38.07 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.27 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  38.07 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  35.84 
 
 
402 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  36.41 
 
 
417 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  36.58 
 
 
408 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  36.87 
 
 
407 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  37.28 
 
 
407 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  35.71 
 
 
395 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  37.82 
 
 
427 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  36.24 
 
 
431 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  36.43 
 
 
411 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  36.87 
 
 
407 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  36.79 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35.22 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  36.12 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  34.89 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  35.51 
 
 
409 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  35.99 
 
 
423 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.07 
 
 
408 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  36.72 
 
 
370 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  35.32 
 
 
395 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.27 
 
 
426 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  33.71 
 
 
430 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  34.35 
 
 
435 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  34.91 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  33.72 
 
 
468 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  33.88 
 
 
425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  35.84 
 
 
422 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  34.31 
 
 
395 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  34.9 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  34.52 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  34.91 
 
 
438 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  35.84 
 
 
400 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  36.55 
 
 
613 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  32.86 
 
 
409 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  32.86 
 
 
416 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  35.43 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  34.95 
 
 
382 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  33.81 
 
 
432 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  33.33 
 
 
414 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  33.9 
 
 
444 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  35.6 
 
 
440 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.43 
 
 
397 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  34.55 
 
 
430 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  33.74 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  33.42 
 
 
397 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  31.02 
 
 
412 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  34.31 
 
 
401 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  34.31 
 
 
401 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  34.04 
 
 
401 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  34.31 
 
 
401 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  33.77 
 
 
401 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.3 
 
 
437 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  32.54 
 
 
436 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  31.54 
 
 
397 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  33.33 
 
 
401 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  32.6 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  32.99 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  30.75 
 
 
396 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  32.39 
 
 
406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  30.83 
 
 
411 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  32.08 
 
 
393 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  30.13 
 
 
391 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  31.2 
 
 
409 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  29.35 
 
 
396 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  31.99 
 
 
404 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  33.33 
 
 
419 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  37.72 
 
 
431 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  30.26 
 
 
398 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>